2024年度日本食品微生物学会技術セミナー 西日本(大阪)開催案内(第三報)*募集定員に達したため応募を終了しました。

以下のとおり、2024年度日本食品微生物学会主催技術セミナーを開催します。本セミナーは、遺伝子解読技術(いわゆる次世代シーケンサー、NGS)の活用と基本的なデータの取り扱いに関する知識の向上を目的として、講義と実習を行うものです。病原体をはじめとする微生物をNGSで解読したものの、データの扱いがわからない、そこから先どのように進めれば良いか相談したい、といった方を対象としています。なお、本セミナーでは細菌叢解析などのメタゲノムデータは取り扱いませんのでご注意ください。また、本講で主に扱うのはショートリードデータ (Illumina) となりますので、合わせてご注意のほどお願いいたします。 1日目の夜には情報交換会(追って参加予定者にご連絡いたします)を行い、NGSを利用する上で皆さまが直面している課題、トラブルシューティングなどをより深く共有し、向上できる機会となるように企画しております。
皆さまのご参加をお待ちしております。

開催日程

2024年11月9日(土)、10日(日)

9日 13時00分~16時45分
10日 9時30分~16時45分
研修会場
大阪公立大学 I-site なんば
〒556-0012 大阪市浪速区敷津東2-1-41)
定員
12名(6/1よりお申し込み開始、先着順とさせて頂きます)
※WindowsノートPC(OS:Win10以上、メモリ:8GB以上、CPU intel 8th gen以上、無線インターネット接続可能なもの)をご持参ください。
※事前にWSL2 Ubuntuをインストールお願いします。必要に応じて支援しますので、お気軽にご連絡ください。
主な講師
  • 野本 竜平(神戸市健康科学研究所感染症部)
  • 和田 崇之(大阪公立大学大学院 生活科学研究科)
講義内容
NGS解析の基礎知識、UNIXコマンドの基礎知識、リードデータの初歩的取り扱い、アセンブリ・マッピング解析の基本、他
実習内容
コマンドラインの基礎、アセンブリ・マッピングの実践、分子系統樹の画出、他
参加費用
正会員(本人に限る)  5,000円
賛助会員(所属機関が推薦する2名まで)  5,000円
一般(購読会員・非会員) 10,000円
振込先
りそな銀行市ケ谷支店 普通預金口座:0383378
口座名義:日本食品微生物学会事務局
※銀行振込みの際は、参加者氏名の前に、技術セミナーIDとなる「NGS」と
会員番号(非会員の場合は9999)」をご記入して下さい。
大変恐縮ですが、振込手数料については参加者のご負担でお願いいたします。
参加方法
*募集定員に達したため応募を終了しました。
下記URLよりお申込みいただけます。
規定人数に達している場合、すでに受付を終了している可能性があります。
https://forms.gle/ZQTWywipgQCnu2VX7
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お問合せ・お申し込み

大阪公立大学 和田 崇之
住所:〒558-8585 大阪市住吉区杉本3-3-138 生活科学研究科食栄養学科微生物学教室内
TEL:06-6605-2910
E-mail : twada@omu.ac.jp(スタッフ不在のため、できる限りEメールをご利用ください)

予定スケジュール

第1日

13:00-13:05 開講の挨拶
日本食品微生物学会理事 大阪公立大学大学院教授 山崎伸二
13:05-16:15 講義
  1. NGS解析の基礎
  2. UNIXコマンドについての基礎知識
  3. 微生物のバイオインフォマティクス解析の現状(できることできないこと)
実習
  1. Minicondaを用いた汎用ツールのインストール
  2. fastqファイルのトリミング
  3. ゲノムアセンブリ
16:15-16:45 質疑応答
大阪公立大学大学院教授 和田崇之
神戸市健康科学研究所感染症部副部長 野本竜平

第2日

   
9:30-12:00 講義
  1. SNP解析の基礎
実習
  1. 細菌ゲノム配列を用いたSNP解析
  2. 系統樹作成等結果の図示
12:00-13:00 昼食
13:00-16:15 実習
  1. 午前中の続き
16:15-16:45 質疑応答
大阪公立大学大学院教授 和田崇之
神戸市健康科学研究所感染症部副部長 野本竜平

過去の技術セミナー一覧